Eur J Endocrinol：石蜡标本核苷酸组分析在肾上腺皮质癌诊断和预后中的价值

背景：血清素腺癌(ACC)是一种罕见的内分泌腺癌(每年每百万人里有1-2例)，总质病因较差。病因对病患管理至关不可或缺，但由于这种传染病的罕见，病因很不便。事实上，在血清素(ACT)里，ACC是罕见的，大多数是血清素腺瘤(ACA)。解剖恶连续性总分称为Weiss总分，最常用于病因。然而，具备里等总分和罕见结核DNA突变的不容易被定义。特别是，未确定由大细胞内和阿米巴酸连续性颗粒一组合而成的阿米巴酸连续性DNA突变质的恶连续性是具备挑战连续性的。

ACC的5年总质肉食动物率一般低于40%，但异质连续性。病因整体对指导治疗法决策很不可或缺，在在辅助治疗法。临床上用到的收纳要病因因素是分期Ki-67再生指数。其他病因因素通常包括皮质醇分泌和年龄。

以前的DNA一组研究表明，DNA一组DNA突变集里在各有不同的本土化学键亚标准型。磷酸本土化一组左概要是本土化学键定义的基石。磷酸本土化一组左概要将血清素腺瘤与腺癌区分开来，并鉴定不止两一组与病因密切相关的ACC：“C1a”亚一组，其再生DNA过度表示，病因不良；“C1B”亚一组，具备免疫特征，病因较好。从磷酸本土化一组特征，已推断不止特定的mRNA标记，如BUB1BPINK1的差异DNA表示。这些靶向标记物更佳了ACC的病因和病因评估。然而，到迄今为止，磷酸本土化一组左概要及其靶向替代标记物仅限于高品质的RNA，需要高品质的冰冻一组织滤波。在常规实践里，获取这种类标准型的工艺要求很高，而对于ACC病患来说，往往无法解决问题。

最近的3’RNA高通量核心技术捕获并高通量了多天冬氨酸本土化RNA 3’端的短片段，这些片段不太容易被RNA降解。与DNA表示微阵列或标准的正因如此长RNA高通量各有不同，这种核心技术只需要少量和低质量的RNA，与甲醛固定石蜡包埋(FFPE)滤波接口。

目地：收纳要目地是利用新的3’端RNA高通量核心技术，未确定甲醛固定石蜡包埋(FFPE)滤波的磷酸本土化一组左概要。第二个目地是通过要点研究罕见的阿米巴酸细胞内ACT变质，展示这种核心技术探索大标准型FFPE档案室的能力。

方法：我们纳入131例ACT：来自科钦医院的基础训练路由表和来自班贝格医院的独立国家检验路由表。用QuantSeq(Lexogen)和NextSeq500(Illumina)从FFPE滤波里激发3’磷酸本土化一组。

结果：在基础训练路由表里，无指派聚类辨识不止3一组：“C1A”标准型洪水泛滥连续性腺癌(N=28，29%)、“C1B”标准型腺癌(N=28，29%)和“C2”标准型腺瘤(N=39，41%)。FFPE磷酸本土化一组的病因价数值在检验路由表里得到证实(5年OS：C1a一组为26%(N=26)，C1B一组为100%(N=10)，p=0.003)。在包括分期和Ki-67的多变量模标准型里，FFPE磷酸本土化一组是一个独立国家的病因因素(OS-HR 7.5，p=0.01)。阿米巴酸连续性炎症内ACT(N=19)未形成任何特异簇。阿米巴酸细胞内腺癌(N=6)和恶连续性潜能未明的阿米巴酸连续性细胞内腺癌(N=4)均为“C1B”。

左图1.基础训练路由表里ACT的FFPE磷酸本土化一组定义A.基于2000个最易变的DNA对ACT的非指派定义未确定了三个收纳要一组，对应于“C1A”洪水泛滥连续性腺癌、“C1B”惰连续性腺癌和“C2”腺瘤。B.用于生成非指派定义的3个非负向量分解(NMF)等级的热左图。激素(肾上腺分本土化)、再生和免疫前兆在每种ACT里的表示。D.三一组磷酸本土化一组里差异最显著的前50个DNA的表示谱。即通过插数值聚类算法表示滤波彼此之间的相似度的一致连续性向量。行和列是病患滤波。共识向量数值的范围从0(从不那时候)到1(丝毫那时候)。

左图2.各有不同区域内的FFPE磷酸本土化一组定义。对基础训练路由表里5名病患的两个各有不同区域内进行苏木俱/伊红/赛弗兰染色(放大40倍)，其里一个为洪水泛滥连续性(-a)区，一个为非洪水泛滥连续性(-b)区。黑条代表50微米。黑色方格表示有丝分裂。白色方格表示不典标准型的有丝分裂。B.描述为5名病患滤波的两个各有不同的区域内，其里一个是洪水泛滥连续性(-a)，另一个是洪水泛滥连续性(-b)。不适用范围：Fuhrman核级不适用范围于阿米巴酸连续性细胞内。C.基于PCA的两个收纳成分(Dim1、Dim2)的滤波投影基于基础训练路由表的95个与众各有不同病患里的2000个最可控DNA。来自基础训练路由表的滤波表明为磷酸本土化一组高一上色的含糊方格。来自两个各有不同区域内的8名病患的滤波按病患的颜色表明为正因如此直角三角形。

左图3.ACC检验路由表里的FFPE磷酸本土化一组定义和病因A.滤波投影基于PCA的两个收纳成分(Dim1，Dim2)，基于基础训练路由表里95个与众各有不同病患里最可控的2000个DNA。来自基础训练路由表的滤波表明为磷酸本土化一组高一上色的含糊方格。来自检验路由表的滤波以磷酸本土化一组一般来说上色的完整直角三角形表示。B.根据检验路由表里I-III期ACC病患的预见磷酸本土化一组类标准型进行无病肉食动物。根据检验路由表的I-IV期ACC病患的预见磷酸本土化一组定义，总的乳癌。

结论：3’RNA高通量法是从FFPE滤波里未确定ACT本土化学键类标准型的一种有用方法。这项核心技术应该更容易常规用到和大标准型总结研究。

译者不止处：Jouinot A, Lippert J, Sibony M,et al.Transcriptome in paraffin samples for the diagnosis and prognosis of adrenocortical carcinoma.Eur J Endocrinol 2022 Mar 01